El Museu da Farmácia localizado en el edificio de la Asociación Nacional de Farmacias, en Rua Marechal Saldanha, 1 Santa Catarina (Lisboa), fue inaugurado en junio de 1996. Las primeras piezas que dieron origen al museo fueron donadas a la Asociación Nacional de Farmacias por el Dr. Salgueiro Basso a las cuales seguirían otras donaciones. El conjunto de piezas de este museo representa 5000 años de la historia de la salud y está constituido por muchas piezas de diverso origen geográfico (Egipto, Roma, Mesopotamia, etc.), siendo destacable, la reconstrucción de cuatro farmacias, como por ejemplo una farmacia de Macau, así como una farmacia portátil del siglo XVIII. En el museo también se muestran diversas máquinas y aparatos utilizados por los farmacéuticos para fabricar medicamentos, tales como pesas, tarros, albarelos, etc.
La colección egipcia se limita a una sala, bien organizada y bien etiquetada de construcción moderna. El museo de la farmacia recibió los años 1996, 1997 y 1998 el premio al mejor museo portugués.
